केवीएस में, एनसीएससी तीन चरणों में कार्यान्वित किया जाता है, यानी स्कूल स्तर, क्षेत्रीय स्तर और राष्ट्रीय स्तर। क्षेत्रीय स्तर पर, विभिन्न केन्द्रीय विद्यालयों के 300-400 बाल वैज्ञानिक अपनी परियोजनाएं प्रस्तुत करते हैं। केवीएस राष्ट्रीय स्तर पर भाग लेने के लिए 25 क्षेत्रों से लगभग 450 उत्कृष्ट अभिनव परियोजनाओं का चयन किया जाता है। केवीएस, 42 अनुकरणीय परियोजनाओं वाला एक राज्य, राष्ट्रीय स्तर की एनसीएससी में भाग लेता है जिसमें 28 राज्य, 8 केंद्र शासित प्रदेश और 9 खाड़ी देश भाग लेते हैं।
केवीएस राष्ट्रीय स्तर की एनसीएससी में आगे की भागीदारी के लिए 25 क्षेत्रों से 449 रचनात्मक और अभिनव परियोजनाओं में से 42 अनुकरणीय और आशाजनक परियोजनाओं का चयन करता है, जिसमें तीन सीएसडब्ल्यूएन श्रेणी की परियोजनाएं शामिल हैं।
